Weed Mapping (Sugar Cane – Brazil)

This page contains our Orthomosaic Dataset of RGB aerial images for Weed Mapping and Segmentation and its Ground Truth (GT). It depicts a sugar cane plantation in Northern Brazil, captured as a single UAV-acquired sugarcane field orthomosaic. The image was captured from an Horus Aeronaves (https://horusaeronaves.com/) fixed-wing UAV employing a visible light RGB Canon G9X camera.  The UAV captured the data following a flight altitude of 125 to 200 meters, resulting in an approximate  spatial resolution of 5cm/pixel.

The images can be downloaded at full resolution by either accessing the direct links under the illustrative low-resolution images below or by clicking at the images themselves.

 

Original Image

sugarcane2 

[Link for direct download]

Ground Truth

From the dataset an expert biologist produced a human-made ground truth (GT). The expert classified the whole image manually, using the GNU image manipulation program (GIMP). All pixels of the image were classified into three classes: crop row (green), weed (yellow) and background (red).  Out-of-boundaries pixels are black. This GT representation allows the direct usage of the GT in machine learning environments that employ the Pascal VOC standard.

crop6GT

[Link for direct download (ground truth image)]

Exemplar Results

results2

Code

The Jupyter Notebook employed to generate our results is available in the following repos:

Refer to the jupyter notebook installation guide or import the file with Google Colaboratory to visualize the code.

Acknowledgements

We wish to thank Horus Aeronaves (https://horusaeronaves.com/) for acquiring and offering the dataset. There are no conflicts of interest.

This work was the result of a collaborative effort of a team of engaged researchers:

  • Alexandre Monteiro <xandemont@gmail.com>
  • Paulo Cesar Pereira Junior <pcpereiraj@gmail.com>
  • Antonio Carlos Sobieranski <asobieranski@gmail.com>
  • Rafael da Luz Ribeiro <rl.ribeiro@outlook.com>
  • Marcelo Ricardo Stemmer <marcelo.stemmer@ufsc.br>

Related Publications

  • Weed Mapping on Aerial Images – A Systematic Literature Review. Paulo César Pereira Júnior, Alexandre Monteiro and Aldo von Wangenheim. Technical Report INCoD/LAPIX.01.2019.E (May, 2019) [PDF] [DOI: 10.13140/RG.2.2.34979.71204]

Mapping Weeds and Crops in Precision Agriculture with Convolutional Neural Networks

Citing this Dataset

@misc{WeedMappingDataset2019,
  author = {Monteiro, A.A.O. and von Wangenheim, A.},
  title = {Orthomosaic Dataset of RGB aerial Images for Weed Mapping},
  year = {2019},
  publisher = {LAPIX/UFSC},
  journal = {INCoD Datasets Repository},
  howpublished = {\url{http://www.lapix.ufsc.br/weed-mapping-sugar-cane}}
}

cc

Sobre o Autor

possui graduação em Ciências da Computação pela Universidade Federal de Santa Catarina (1989) e Doutorado Acadêmico (Dr. rer.nat.) em Ciências da Computação pela Universidade de Kaiserslautern (1996). Atualmente é professor Titular da Universidade Federal de Santa Catarina, onde é professor do Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação e dos cursos de graduação em Ciências da Computação e Sistemas de Informação. Tem experiência nas áreas de Informática em Saúde, Processamento e Análise de Imagens e Engenharia Biomédica, com ênfase em Telemedicina, Telerradiologia, Sistemas de Auxílio ao Diagnóstico por Imagem e Processamento de Imagens Médicas, com foco nos seguintes temas: analise inteligente de imagens, DICOM, CBIR, informática médica, visão computacional e PACS. Coordena o Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia para Convergência Digital - INCoD. Foi o criador e primeiro Coordenador do Núcleo de Telessaúde de Santa Catarina no âmbito do Programa Telessaúde Brasil do Ministério da Saúde e da OPAS - Organização Pan-Americana de Saúde e criador do Núcleo Santa Catarina da RUTE - Rede Universitária de Telemedicina.